大神一郎远赴法国担任巴黎华击团的队长之后，帝都花组迎来了新团员——前星组队长拉奇特(ラチェット·アルタイル）。拉奇特的个人主义作风与花组重视合作的做法形成强烈对比，双方摩擦不断。剧情的主线在于军方试图以新研发的无人驾驶蒸汽机取代花组，令花组陷入了解散危机。

《樱花大战》系列1997年推出的第五部OVA，舞台转换到了新时代的纽约。共6章，内容分别为：1、我和我的女孩，2、X…and The City，3、在星光闪耀之夜，4、母亲，我想唱歌！5、禁断的乐园，6、比纽约更久远

以游戏第2作以后，准备转任法国巴黎的大神一郎回忆队员的往事。前4集每集各为一个小单元，最后两集为一个小单元。

太正二十九年，帝都·东京。曾经对帝国华击团憧憬的少女独自一人，走上帝都的舞台、再次掀开新传说的幕布。

太正十一年，以妖僧天海为首的邪恶组织“黑之巢会”蠢蠢欲动。仇视近代文明的天海为了复辟德川幕府的统治，率领手下的葵叉丹、弥勒、修罗、罗刹，操纵着古代咒法生出的魔操机兵在帝都展开了破坏活动。为了守护帝都和民众，新的政府直属对降魔组织帝国华击团（简称“帝击”）花组成立了。在米田一基、藤枝菖蒲的领导下，花组集结了6名具备高灵力的少女：真宫寺一马的女儿、灵剑·荒鹰的继承者真宫寺樱；神崎财阀总帅忠义的孙女、精通神崎风尘流长刀术的神崎堇；俄国革命的勇士、曾有“食火鸟”之称的玛丽亚·橘；自幼就因超常的灵力被隔绝、年仅10岁的法国贵族千金爱丽丝；在战乱中失去亲人、精通机械的中国少女李红兰；以及桐岛流空手的正统传人、身高近2米的桐岛神奈。以银座大帝国剧场为基地、平日以歌剧团的表面掩人耳目的花组，在魔物出现时就会变为守护帝都的战士，驾驶光武与敌人作战。太正十二年春，苦于战力及协作性不足的花组来了一位新队长——海军少尉大神一郎，《樱花大战》的故事就从这里开始。